第二集中，尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从内部摧毁“母体”，他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷，思想却被困在介于“母体”和真实世界的中间地带，这个地方由“火车人”控制。墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了尼奥的情况，在守护天使的带领下， 找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇，经过一番激斗，将尼奥救了出来。
此时，电子乌贼部队对锡安发起了猛烈的攻击，人类组织所有机甲战士展开顽强的抵抗，形势危在旦夕；尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船克服重重困难，到达机器城市，尼奥终于见到了机器世界的统治者“机器大帝”，双方谈判并达成了协议：尼奥除掉不受“母体”控制的史密斯，以换取锡安的和平。
在“母体”中，尼奥和史密斯展开了关系人类生死存亡的最后决斗
![POKÉTOON 等着我！鲤鱼王[电影解说]](https://img.lzzyimg.com/upload/vod/20240704-1/8c8e2f30ff0fa02c35d5704f09701e71.jpg)
![POKÉTOON 梦的花蕾[电影解说]](https://img.lzzyimg.com/upload/vod/20240704-1/a747d255a36fda3fcace4884e0c5f836.jpg)
![POKÉTOON 飘雪的暑假[电影解说]](https://img.lzzyimg.com/upload/vod/20240704-1/c068fa997a1ff67092591022e50c6a2b.jpg)
![POKÉTOON 我变成耿鬼！？[电影解说]](https://img.lzzyimg.com/upload/vod/20240704-1/6d586006a51643a9a20b7f8bdfdc3f37.jpg)
